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正規ディーラー車か、そうでない（＝並行輸入車）かは、車検証の「型式」欄を見ればわかります。「不明」と表示されていたり、アルファベットや数字の前後に「-」（ハイフン）が付加されているようであれば並行車です。
詳しくはここを参考にしてください。
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E8%BC%B8%E5%85%A5%E8%BB%8A_%28%E6%97%A5%E6%9C%AC%29#.E4.B8.A6.E8.A1.8C.E8.BC.B8.E5.85.A5.E8.BB.8A
ただ、ゴルフの並行車はあまり見掛けません。特に右ハンドルは見ないですね。正規輸入車が国内に多量に出回っているのでわざわざお金を掛けて並行輸入する理由がないからです。
ディーラーが販売する認定中古車は保証がついていますので安心ですが、その分値段に上乗せされていますのであまりお買い得感はありません。ある程度壊れることを想定して一般の中古車店から安く買うという選択もアリだと思います。
電装品を中心にいろいろ壊れることは覚悟しておいてください。ただ、メンテナンスに関しては、正規ディーラーであるトヨタ系のDUOが全国にありますので、並行輸入車でない限り、どうにもならなければそこに持ち込めば何とかなります。輸入車としては最もメンテナンスが容易（安価ということではありませんので念のため）です。