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TimeMachine内のデータはTimeMachineにしかわからない特殊な方法でデータを記録していくので、勝手にデータをいじるとTimeMachineがデータを解釈できなくなって復元不能になる可能性があります。TimeMachineのデータはユーザが直接いじってはいけません。

TimeMachine内のデータを別の場所へコピーするくらいならTimeMachine内のデータが変化する可能性は非常に低いとは思いますが、それでも危険な香りはします。

OSのバージョンが離れているし上位から下位へのデータ移動なのでどこまで可能なのかわかりませんが10.5にもTimeMachineは搭載されているのでTimeMachineでMacBook Black内にユーザフォルダの復元をしたらどうでしょうか。これならTimeMachineの他にもうひとつユーザデータのコピーが作られることになるから安心かと。

MacBokProが修理から戻ってきて内蔵ハードディスクが初期化されていたらまずTimeMachineで修理前の状態に復元して、次に修理中にいじったデータをMacBookの中から手動で持ってくる。というのがいいのではないでしょうか。

現在TimeMachineのデータが唯一の重要なデータでバックアップがどこにも存在しないというのはそれ自体がかなり危険です。修理中のMacBook Proが内蔵ハードディスクを初期化されずに戻ってくればいいですけど。MacBookProのハードディスクが初期化されて戻ってきて、しかもその間の作業でTimeMachineデータを壊してしまっていたら全てがパーです。そうなる可能性は低いとは思いますが、現在ご質問者さんの手元にあるTimeMachineデータはそれほどまでに重要なものであることを認識した上で慎重に取り扱ったらいいと思います。

状況がよくわかりませんが。
作業されている外付けハードディスクは、TimeMachineでバックアップを取られたハードディスクとは違いますよね。
同一ハードディスクなら、止めた方がよいかと。別途準備する。
また、外付けハードディスクにしか作業した最新のデータがないのですよね、バックアップなしの状態？は危険では。

【補足に対して】
Appleが問題ないと言っていれば…。
より安全は、別のハードディスクを準備する事でしょうか、データは２つ以上。
リスクは軽減。
OSのバージョンが違うので手動で、制作データのみを差し替えで良いと思います。