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Core 2 Duoでも性能はかなり良いですが、今はQuadとの価格差が小さくなってきたので先の質問の回答者はQuadを勧めたのでしょう。

お手持ちのPhotoshopはクアッドコアCPUに対応しているので、4つのコアをフル活用して高速に処理を行うことが出来ます。ですので、Core 2 Quadに変更することをお勧めします。

>どちらが良いですか？
1月に価格改定が行われたCore 2 Quad Q9650(3GHz、6MB*2 L2)が良いです。予算を抑えたいのであればQ9550でも十分でしょう。

>この150の差はなんでしょう？
数字の差で見るのではなく、4つの数字で見ます。現在のYorkfieldコアのCore 2 Quadは、2次キャッシュの容量の違いで大きく分けて3種類あります。Q8x00は2MB*2、Q9x00は3MB*2、Q9x50は6MB*2です。xの部分の数字は動作クロックの違いで、製品の動作クロックは2+x*0.16(GHz)で求めることが出来ます(例えばQ8200は2+2*0.16で2.33GHz)。
つまり、Q9400は2.66GHzで2次キャッシュは3MB*2、Q9550は2.83GHzで2次キャッシュは6MB*2です。

追記:
Photoshop 7は2コアまでの対応のようです。コア数がそれ以上でも使用できますが、全てのコアを使い切ることは出来ません(同時に別の作業をすると使いきれます)。
また、Photoshop 7はWindows Vistaでも使用できるとの報告があるので、メモリ管理が苦手なXPをあえて選ぶ理由も薄いです。
http://windowsvista.ms/index.php?soft#adobe

Q9400はキャッシュ容量が少ないのであまりお勧めできません。Q9550/Q9650の方がキャッシュ容量が多い分やや速いです。