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まず、質問者さんのパソコンで使えるかどうか？をよく確認してください。
使えないものを買ってもそれこそ無駄になってしまいます。

どちらも使えるというのであれば、質問者さんが何を重視したいかによります。

価格を重視するのであれば、お安い方ということになると思いますが、新作のほうが機能は充実していると思います。

付属ソフトを重視しているようならば、ComicStudioやIllustStudioのMiniバージョンは同人制作には使えないので、おすすめしません。
どちらもあくまでお試し版のソフトなので、印刷ができない（できても透かし文字が入ってしまう）大きいサイズで書き出しできないなどの問題があるので、そのソフトを使って同人誌をつくろうと思うと、結局お金を出して有料版のソフトを買わなければなりません。
Mini版を持っていることで、有料版ソフトを買うときに割引されるサービスもありますので、どちらがよいかよく考えてから決めると良いと思います


使い勝手を試したいのなら、大きめの電器店に足を運んでみると良いかもしれません。
サンプルとして実機が置いてあるお店もありますよ。