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>サムネイル画像は問題ないのですが
>画像の一部だけ（下から３分の１ぐらいが、おかしなものがおおいです

画像ファイルが壊れています。
途中から色が変わってしまったりする場合は、
データが途中で欠落などして以降のデータがおかしくなっている。
下の方が灰色になっているような場合は、その部分のデータがありません。

サムネイルが正常に表示されるのは、
サムネイルの画像データが、ファイルの先頭の方に埋め込まれているからです。

画像破損の原因については、判断しかねます。
HDDの不調、回線の不調による不完全ダウンロード、元画像の破損
それぞれ、すべて可能性がありますが、
ダウンロードの画像だけで頻発するなら、不完全ダウンロードの可能性が一番高いです。
レジューム機能のあるダウンロード支援ソフトなどが使えるのなら、
そのようなものを使って、完全にダウンロードできるよう注意するしかないです。

気をつけるべきことは、画面に表示されているファイルのサイズと
ダウンロードしたファイルのサイズが同じかどうか確認することです。

外付けHDDの不調かどうかは、
一度Cドライブに保存して、それを外付けにコピー貼り付けする
同じ画像を、直接外付けHDDに保存する
このようなことして、
C保存の画像、コピー貼り付けした画像、直接ダウンロードした画像
このそれぞれを比較してみればよいのではないですか。