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>パーティション分けして、使用するとhddの寿命に影響しますか？
HDDの寿命は考えないことにしています。すぐ壊れることもあれば、5年6年と使っても何とも無い(それ以前に交換しちゃうけど)ものもあります。何台かは天寿を全うして・・・ツーカッツン・ツーカッツンと息を引き取ったのを見送りましたが。

私は、システムを入れるHDDは、必ずシステム領域とデータ領域に分割しています。複数台搭載できるタワー型でもそうしています。XPで使うなら、システム用としてC:ドライブは30Gもあれば十分。それ以上あっても無駄なだけだと思います。
もちろん、複数台入れてデータ専用として使う物は分割はしませんけれど。

分割して、システムとデータを完全に分離するのは、次に説明されているだけではなく、
http://www.microsoft.com/japan/athome/magazine/ucontents/users/winXP/0503/default.aspx

Acronis True ImageやEASEUS Todo Backupなどのバックアップイメージ作成ソフトが使いやすくなるのが最大のメリットと思っています。http://www.forest.impress.co.jp/lib/sys/file/syncbackup/easeustodobu.html これらで、C:ドライブをバックアップしておけば(当然D:ドライブも別途バックアップ)、Windowsが狂ったくらいなら10分、HDDが壊れても交換して数時間で元通り復旧させることができるようになります。これが、C:ドライブ単一で、システムもデータもゴチャ混ぜだと、バックアップを作るのも、Windowsが狂った場合に復元するのも大変な作業になってしまうでしょう。

このように日常的に完全にバックアップを取ってあるので、内蔵HDDがいつ壊れても全く心配なし。実際先日何の前触れも無く突然ブッ壊れましたが、4時間後には完全復旧。メール一つ失った物はありませんでした。

>安くて問題ないならWDもいいとは考えますが2ＴＢはむかないですか？
問題大有り!! 4KBセクターにはXPは対応して無いのでいろいろ問題が起こる可能性大ですね。最近は4KBセクタの品が増えたようで･･･購入時に注意が必要ですね。これもXP包囲網かなとは思います。