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①
相違点は、ソフトの有無・タッチ可不可・ファンクションキー（ワンタッチショートカットキー）の有無・ペン後ろによる消しゴムの有無・サイズバリエーションといったところでしょうか。
ペンタブの心臓部である筆圧機能の性能は変わりありません。

②
BAMBOO COMICに付属するソフトにもフリーソフトが同梱されています。ちなみに付属ソフトはすべて、そのフリーソフトか、廉価版（正規版と比べて機能に制限あり）です。
もちろん廉価版とはいえ描けないことはないですが、そこまで魅力的というわけでもありません。
大抵のユーザーが、のちのち正規版を買うことになり、お得ではなかったと感じているようです。

③
ご希望サイズがM以上ならCOMICしか選択肢はありませんが、SサイズでよろしいならPenの方がおススメです。
予算の件があると思いますが、COMICがSサイズで10980円。
Penが同じくで6980円です。

ペイントツールでかなり有名かつ評価の高いソフトで、SAIというものがあります。こちらは税込5250円ですので、Penと足すと約12000円ほどです。
COMIC＋1000円ほどですので、こちらの方が絶対お勧めです。
SAIはプロの方から初心者の方まで満足して使い続けられますし、デジタル絵の最初の難関である線画の難しさを解消してくれます。

SAIは30日間無料で本体をダウンロードして試用できます。
SAIで検索すれば出るので、ペンタブが届いたら試してみてください。

ちなみに上記の価格は公式価格なので、アマゾン等ではもう少し安いと思います。



補足を受けて：
それでもPenでいいと思います。
一例で、COMICについてくるソフトにPIXIAがあります。
こちらは普通にネットで「PIXIA ダウンロード」と検索すれば手に入るものです。
その他のソフトには漫画向きのソフトなどがありますが、使用用途はイラストと質問文に書いていらっしゃるので、そんなに使うこともないかと思います。

本文にも書きましたが、多少のペンタブのオプション部分に違いはありますが、そこを気にしないならPenですね。
ちなみにPIXIAをダウンロードするときはバージョン4.70をお勧めします。
使い方等はいろんなホームページや、PIXIVという投稿サイトで「PIXIA 講座」と検索することで参考物が出てきます。

また、他にも「フリーソフト ペイント（もしくはイラスト）」と検索すればいろんなフリーソフトがありますので、しばらくはそれで楽しめると思いますよ。