質問者が納得バックアップファイルを暗号化されなかったのではないですか？暗号化するボタン所に、暗号化するとメールアカウントも保存しますと書いてあります。つまり暗号化しない時はメールアカウントは含まれないという意味です。Eメール(i)のメール設定は一括設定を使って行うのが最近の主流ですので、下記リンクを見ながら再設定してください。
「iPhone の一括設定方法」
http://mb.softbank.jp/mb/iphone/support/mail/package_setup/
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