質問者が納得NEX-F3ではないですが、基本的に動画データと写真データは保存される場所が違います。そのため、再生画面からメニューを使って動画データを確認するか、写真データを確認するかを選択しなければなりません。そういった作業は行っていますか?
また、削除したと言っても、どのように削除したのかによってもデータの消え方は変わります。フォーマットなどの削除はすべてのデータを消してしまいますので、避けなければなりません。
パソコン上であればデータが分かれているので、ちょっとフォルダを確認すればわかると思います。
基本的に...
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