iPod touch Freemake Video Converterの解決方法

質問者が納得変換の時にitunesは起動していましたか？ itunesの中を確認しましたか？ たまにエラーを吐いて実はちゃんと転送されているってことはあります。 それでも、だめなら、とりあえず変換は出来るので、 保存先を自分で指定して、変換後自分でitunesのフォルダーに移動したらどうでしょうか？