質問者が納得現在の状態で全く問題は有りません。
追記です。
IDEは1ポート辺り2つの機器を接続できる規格です。
SATAのように全てのポートが独立しているのであれば何も問題は有りませんが、1ポートに2つの機器が接続された場合に区別をしなければPCから見て見分けることができなければなりません。
その都合上のマスター・スレーブです。
機器2台を繋いだ場合、マスターに繋いだほうが若干のメリットはあるといえばありますが誤差の範囲ですし、機器1台ではどちらでも差はありません。
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