質問者が納得お疲れ様です！
VIPER5601の詳細は知りませんが分かる範囲で（想像でw）
＞エンジンスタータを作動させた際、セルだけがまわり、エンジンが全くかかりません。
＞こういった症状の場合は、まずドコを確認すれば正常に動作するようになるでしょうか。
破線の接続は間違っていませんか?
簡単に言えばヘビーゲージ（太い線）のフューズホルダーのある赤線は常時プラスです。
紫＝ スターター（モーター側）
緑＝ スターター（キーシリンダー側）
赤＝ 常時電源(2本）
橙＝ アクセサリー（ACC）
桃...
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