質問者が納得CDからのインストールで問題ないです。
古いバージョンがインストールされていても勝手にアンインストールしてくれますし
同じ機能を持つソフトでも名称が違えば
(Easy Photo Print とE-Photo等)共存できます。
複合機を複数繋ぐと一部の機種の組み合わせで不具合があるので
EPSON Scanメンテナンスユーティリティでの
EPSON Scanの初期化や完全削除が必要な場合があります。
http://faq.epson.jp/faq/00/app/servlet/qadoc?030707
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