質問者が納得スカイプの上部メニューの「ツール」→「設定」を選択。
新しく表示されたウィンドウの「オーディオ設定」の「スピーカー」部分。
選択できるようになってるので、「Windows標準ドライバ」以外を選択。
（使用しているヘッドフォンの型番などが表示されてるはずですので、それを選択）
保存ボタンを押して終了。これでいけるはずです。
つまり、スカイプで使用するマイクはヘッドセットのマイクが選択されているのに
スピーカーはヘッドフォンではなく、パソコンのスピーカーが選択されている状態が
今の状態という事です。
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