質問者が納得私が使わさせていただいているデータバックアップソフトは、「Backup」というソフトです。
＊作者はFFFTPで有名な方です。
http://www2.biglobe.ne.jp/~sota/backup.html
これは自分で好きなフォルダ、データを設定しそれをバックアップしてくれるものですが、
差分（変更のあったものや、元データと違うもの）バックアップなども出来、非常に便利かつ高速です。
もちろんミラーリングといって、元データと全く同じ状態をバックアップ先に反映させることも出来ます。
＊ウチでは万単位...
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