質問者が納得クローン（イメージ）ファイルを入れたＨＤＤを、復元せずにそのまま換装したのですか。
イメージですから、ＴｒｕｅＩｍａｇｅで復元しないと動きません。
つまり、クローンファイルを保存するのは、旧ＨＤＤでも新ＨＤＤでもなく、外付けなど第３のＨＤＤ（もしくはＤＶＤ－Ｒなどのメディア）でなければいけなかったわけです。
それで換装して、ＢＩＯＳのＢｏｏｔＳeｌｅｃｔでＣＤ起動にしてＴｒｕｅＩｍａｇｅのレスキューＣＤで起動させ、クローンイメージを新ＨＤＤのなかに復元させます。
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