質問者が納得ざっと調べたところ、現在のLYNX 3D( Android2.2)でできるroot化は一時的なものであり、プリインストールアプリ削除などは出来ないようです。root化するとドコモの保証外になりますし、失敗すれば使えなくなる可能性もありますし、方法も簡単ではありませんので、ここには書ききれません。自分でやりかたを調べられないくらいでしたら、やめておいた方が賢明です。「LYNX 3D root化」で検索してみましょう。
質問者が納得私はclone dvd mobileを使ったことがないので何とも言えませんがMP4に変換してください。MP4ならスマートフォンで再生出来るはずです。私はソフトは違いますがhandbreak(フリーソフト)というソフトを使ってPCに保存してあるISOファイル(DVD Shrink→ISO)をMP4に変換してXperia acroに保存して見ています。