質問者が納得ショップの選択についていえば、ドスパラの方が若干安く買えるでしょうね。
ただし型番から選べるサイコムやストームがお勧めです。
http://saiyasune.net/btoshop.html
KATANA3にCoolerMasterなら発熱をそこまで気にする事もないでしょうね。
CPUは860でもOKです。
エンコードが頻繁なのであればHDDは2基構成が理想ですね。SSD+HDDなんかもいいですよ。
グラボの選択が難しいですね。GTA４なら5800系が理想ですが価格が跳ね上がります。
価格的には...
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