質問者が納得外付けHDDのパーテーションを別々の形式でフォーマットする事に関しては可能ですが、WindowsNT系のOSでは500GBのような大容量領域のHDDをFAT32でフォーマット出来ません。
ですのでFdiskツールを使うとか、別途にFAT32フォーマットが出来るツールを用意してきてフォーマットする必要が有ります。
ただCG-WLR300Nの仕様上、複数のパーテーションを含むHDDの場合どういう動作になるのかとかそのあたりの仕様がわからないので可能かどうかは不明ですね。
設定を詰めていけば不可能はないと思いま...
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