質問者が納得MFT（マスターファイルテーブル）が壊れているのだと思います。
そのフォルダのデータが必要なら専門業者に依頼するしかありません。
よさそうな業者をピックアップしました。
比較検討してみてください。
オントラック社が有名ですが費用は掛かるようです。
http://www.ontrack-japan.com/
http://www.rescue-center.jp/
http://www.ino-inc.com/util/mediainfo.html
http://www.drivedata.jp/
データ...
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