質問者が納得RAIDを構成することが目的でOSをインストールし直すつもりなら、クローンの作成を行う必要はありません。単純に必要なファイルのみをコピーするだけでOKです。HDDから起動してフォーマットを行う必要はありません。RAID構成時にすべてのデータは失われますし、システムのインストール時にフォーマットを行います。
また、BIOSからSATAの動作モードをRAIDへ変更し、RAID BIOSからRAID0 Arrayを構成します。
容量アップが目的なら、もう2000出してPX-128M5Sでも買ったほうが楽です。
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