質問者が納得HDDの不具合の可能性も有りますが、ケースに問題が有る可能性も排除出来ません。
原因はHDD自体の問題またはケースの不具合の問題のどちらかだと思います。
お使いのパソコンがデスクトップの場合直接マザーに接続してHDDのチェックを行うのも良いと思います。
http://www.forest.impress.co.jp/article/2007/02/22/hdtune.html
フリーのHDD診断ツールです。 オールグリーンなら不良セクタなしでとりあえず問題無し。
またノートパソコンとか直接接続が不安なら...
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