M3 やり取りの解決方法

質問者が納得PCスペックは十分足りてるとの事ですが、肝心のUSBフラッシュメモリーの性能はいかがですか？ RAID0を組み込んだような製品ならともかく一般的なUSBメモリの速度は（特にランダムWriteでは）SSDとは比較にならないほど遅いと思います。