質問者が納得バックアップ専用ソフトでCD起動から元のハードディスクをドライブ丸ごとバックアップしてバックアップ先を新しいハードディスクにしてみてはいかがでしょう。
おそらく今現在作成されているリカバリーディスクは新しいハードディスクにインストールすると、元のハードディスク構成識別子IDと異なる為に正常起動しないものと考えられます。
(追記)
富士通の純正リカバリーディスクではなくWindows7上で作成したイメージディスクは作成されていますでしょうか。
富士通の純正リカバリーディスクの問題はメーカーに問い合わせした...
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