質問者が納得auショップの店員より回答いたします。
正直内容があまりに難しい内容なので一度auショップに行かれたほうがいいです。auショップでは専門の部署があり、そこで確認することもできますが、故障と判断した場合は修理になる確率もございます。
本体の初期化を行うとすべてのデータは消えます。
バックアップはSDカードへ選択するようお願いします。
本体に保存される使用があるのはPCでデータを吸い出すときに使うものかと推測されます。
データが全て消えるというのは以下のもの
ダウンロードしたアプリ
Eメール
Cメール
アドレス...
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