質問者が納得手差しトレイを使えば、印刷時にプリンタのプロパティできちんと設定すれば問題ないはずですが・・・?
また、本体下部にある用紙トレイは、トレイごとに用紙の厚みの設定などが可能です。
http://www.nec.co.jp/products/laser/download/user/printer/pdf/pr_l9750c.pdf のpdfで160ページ以降
普通紙も厚紙もまとめてセットしておくのであれば、トレイを増設して普通紙と厚紙でトレイを分けて使われることをお勧めします。
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