iPhone 5s 有料アプリの解決方法

質問者が納得アプリ自体はバックアップの対象ではありません。通常はパソコン側のiTunesライブラリに同期されていて、復元すれば自動的に新端末にも同期されるはずです。旧端末で、アプリを同期しない設定にでもしてたんじゃないですか。 無料で再ダウンロード出来るので気にしなくてもいいけど。