質問者が納得原因は、システムリソース不足だったり、環境設定ファイルの破損など、さまざまな原因で起こるようです。
アドビのサポートデータベースにある文書番号223241
「パレットやアートボードが表示されない、またはツールの一部が欠けて表示される(Illustrator 9 / 10)」
に、対処方法があります。
詳しくは下記のリンクを開いて、中に書かれているA. ~ G のいずれか、または複数の操作を実行してください。
http://support.adobe.co.jp/faq/faq/qadoc.sv?22324...
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