iPod (5th generation Late 2006) ZIP形式の解決方法

質問者が納得よく分からないのですが、iTunesからtouchに電子書籍読み込み用のソフトを同期して入れます。その後、ＰＣにつないだままtouchのアプリのページを開けば、ファイルを入れる項目が出るはずです。そこでファイルを入れて、同期すればＯＫです。iFunBoxは関係ないと思います。