質問者が納得ワンセグや地デジ放送を録画した物は基本的にプロテクトが掛かっているので変換は出来ません。
ちょいテレのHPを見ましたが、「※録画データのコピーおよびムーブには対応しておりません。」と記述されていましたので、MP4への変換は出来ないと思います。
↓ちょいテレのHPです。「著作権保護機能にも対応」と記述している辺りに、「※録画データのコピーおよびムーブには対応しておりません。」と書いてあります。
http://buffalo.jp/products/catalog/item/d/dh-one_u2/inde...
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