質問者が納得ビットレート(画質を数値化したもの)が高すぎるので、
容量がでかくなってるのだと思います。
録画した後そのまま投稿しようと考えるのではなく、
「録画」→「再変換」→「投稿」
という手順を踏めば、容量を小さくして、
投稿できるかと思います。
とりあえず初心者なら
→http://dl.dropbox.com/u/136728/nicoenc.html
で変換すれば、手軽に出来ると思います。
もっと細かく設定したいなら
→http://nicowiki.com/aviutl_h264.html
でやってみ...
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