質問者が納得暗号化の情報は親機となるWHR-AMG54側で設定・保持されているので、PC側の設定が原因で消えるというようなことは無いでしょう。現象的にバグっぽく、ファームウェアが古いままではないでしょうか?最終ファームはVer.1.43です。
http://buffalo.jp/download/driver/lan/whr-amg54_fw.html
ファームウェアの過去履歴をみますとVer.1.31-->Ver.1.38でAESがらみの不具合修正がありますので、Ver.1.38より古ければ更新してみるとよい...
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