質問者が納得画面の解像度を上げていませんか？
クリーンインストールを行っても改善されないのであれば、
ビデオカードRADEON X300(128MB）の問題かも知れないです。
最新のRADEON X300のドライバを再インストールして、画面解像度を
1024×768程度で再生して見て下さい。
ビデオカード（グラボ）の性能が低いので、解像度を上げるとカクカク動きます。
もしくはグラボの故障か・・・
本文を見る限り、スペック的にも原因はグラボだと思いますが（＾＾；
【追記】
ダメでしたか・・・
他に気になる点をいくつ...
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