質問者が納得普通に、コーデックが足りないからですね。
とりあえず↓こうやればOK。
AviUtlのインストール方法、編集方法、AVI出力、MP4出力
http://www.nicovideo.jp/watch/sm13560379
AVIファイルってのは、色んなコーデックの映像や音声を入れる事が出来ます。
つまり、コーデック=AVIではないんです。AVIは単なる入れ物。「コンテナ」と呼ばれるものです。
そのAVIコンテナの中に、映像データ、音声データが格納され、それぞれにコーデックが存在します。
AVIには、例えば...
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