質問者が納得はじめまして。
検査の工程としては有り得ない見落としに感じます。
仮に私の立場でしたら、もちろん修理はしてもらいますが、部品代(入り値)で交渉します。
これから先も何らかの修理点検で世話になると思いますが、他にディーラーや修理点検などしてもらえる工場があるのでしたら乗り換えるのも手ですね。
設定間違いや原因の未解明並びに不手際が立て続けにあったとの事ですから次も無いとは限りませんからね。
お怒りの具合にもよりますが、言い訳ても受け取られますからある程度のこちらからのアクションは必要に感じます。
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