質問者が納得既に回答にあるのと反対の回答になりますが、デスクトップ右クリック→アイコンの整列で「アイコンの自動整列」にチェックを入れてください。その上でアイコンを目的の順番にドラッグすれば、以後勝手に順番が変わることはありません。補足への回答改善できないだけであれば、PCのトラブルではなくデーターの移動に関わる問題だと思います。実際フォルダーを含め何を移動したのかが定かでありませんから、あくまで憶測の域を出ません。どうしても正常に戻したいのであれば、リカバリーをするしかないでしょう。
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