Mac Pro データ量の解決方法

質問者が納得まだ新しいMac Pro内にデータが沢山無いのであれば、OSXを再インストールすることをおすすめします。その際HDのフォーマットをMac OS 拡張（ジャーナリング）の大文字／小文字の区別アリを選択します。クリーンインストールしたくない場合、iPhotoを一旦終了して、内蔵HD内のiPhoto Libraryフォルダを削除してからコピーすれば問題無いはずです。内蔵HDにしかない写真は消えてしまいますが。。。