質問者が納得Dockにはアプリケーションなどへのショートカットが登録されているだけなので、Dockから削除してもアプリケーションには影響はないはずなんですけどね。まず、「アプリケーション」フォルダにシステム環境設定が存在するか確認してください。存在する場合は、それをDockにドラッグ&ドロップすればDockに登録できます。存在しない場合は、インストールディスクからシステムを上書きインストールし直してください。それでも駄目なら、クリーンインストール（全フォーマットしてインストール）をしてみてください。
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