質問者が納得一番の「違い」はメーカーが違うコトです。
ソニーは記録カードが「メモリースティックDuo」、パナソニックは「SDカード」です。
カードの価格からいけば「SDカード」の方がはるかに安価です。また、PCに接続する場合にも、多くのPCが「SDカード・スロット」を搭載してます。「メモリースティック」はソニー以外は採用していません。
その点が、人気に反映されているのだと思います。
なお、性能的には「同一」ですね。家電量販店などで「実機」に触れて決めていただければよろしいかと。
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