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ちょっともったいなかった、というより、それだけの環境があれば、とりあえず可能です。
しかし、ムービーメーカーでは全くだめです。
ここはだまって、このソフトをお使い下さい。

http://www.thomson-canopus.jp/catalog/edius_neo/edius_neo_index.php
できれば、これ。
http://www.thomson-canopus.jp/catalog/edius_pro/edius_pro5_index.php

多少の出費になりますが、ハイビジョンというより今時のビデオの編集には、これくらいの出費は、カメラの費用等とのバランスを含めて考えても、当然の費用と思われます。
結果的には、決して後悔しないことを保証致します。
（ノンリニア編集を１０年以上やってきている者からの忠告としてお聞き頂ければ幸いです）

ＡＶＣＨＤとHDV1080iとの違いなど．．に関しては、説明は非常にむずかしいのですが、一言で説明すると。

ＡＶＣＨＤは１９２０＊１０８０などのフルＨＤを、民生機器の非常に貧弱なＨＤＤやメモリに押し込むために、高度に圧縮したものであり、テープ式ＨＤＶに比べると、２－５倍ほど圧縮率が高くなっています。
ＨＤ動画の場合は、単なる圧縮ではなく、フレーム圧縮という手法を使います。フレーム圧縮の概念は、これを参照して下さい。
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1423827229

ＨＤ映像は、今までの画質（ＳＤ）に比べれば、だまって４－６倍以上のデータを食うわけです。
そこで、なんらかの圧縮をしないと、今までのメディアには入りきらないわけです。
デジカメでおなじみの、ＪＰＥＧという圧縮はご存じだと思います。今はこの「圧縮」というものが普通になっています。
しかし、動画では、こんな化石のような原始的な圧縮方法では、とうてい収まらずに、先に述べた高度なフレーム間圧縮が幅をきかせているのです。
しかし編集する場合は、このフレーム圧縮というのは、編集というものの性質上、大変大きな障害になります。
ＰＣの能力が非常に高い場合は、フレームを復活させながら編集が出来るはずなのですが、カット編集以外では、現実に現在あるＰＣでは、完全に能力不足であるといえます。
圧縮率が低いほど、編集作業は精度の高いものになり、同時に楽になります。
現時点でのＰＣでは、とりあえずＨＤＶはリアルタイムに編集できる可能性が高い、というところでしょうか。
しかし、それ以上にＨＤＶのメリットは、ＳＤへの出力が容易・保存性・というところにもあるのではないでしょうか。
また、画素数的にはＡＶＣＨＤの方が高いものの、実際販売されているカメラを見ればわかりますが、トータルのクオリティは、まず間違いなくＨＤＶの方に軍配が上がるでしょうね。
（今時、画素数だけでデジカメのクオリティを論じているマニアはいないでしょう。ビデオも同じで１９２０と１４４０を比べて、フルの１９２０でないとダメ、という人の方がダメであり、レンズやＣＣＤ・ＭＯＳセンサーの性能・圧縮エンジンのクオリティの方が遙かに、トータルの画質に影響するのです）

先にお勧めしたソフトでは、ＡＶＣＨＤにしてもＨＤＶにしても、フレーム圧縮されたデータであるため、これを一端、フレーム圧縮無しのデータに置き換える（ＨＱコーデック）ことにより、その後の編集精度（画質やレスポンス）を高める大きなメリットがあります。（昔の？ＤＶの編集と同等以上のレスポンスでの編集ができます。プレビューもそのままで）
唯一の欠点。フレームを戻すために、データ量が大きくなります。＝ＨＤＤの容量を食う。

しかし、今や、１ＴＢのＨＤＤの価格は８０００円を切っているのですから、ＨＤの編集には、このソフトの使用を是非お勧めしたいのです。
http://www.watch.impress.co.jp/akiba/hotline/20090314/p_hdd.html

参考までに、過去の私の回答をご参照下さい。
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1021050145
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1122816076