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iPodをお使いなら確実に音質は向上します。

これはiPod側のヘッドホン端子やボリューム周りのできが悪いからで、ドックコネクタ経由でヘッドホンアンプに繋ぐ必要があります。

アンプの能力に余裕がある方が、音質に悪影響を与えにくいので、他のプレーヤーでも音質が良くなる場合が多いです。

他の方のコメントに部品の価格を指摘しているものがありますが、モノの価格なんてそんなものです。
パソコンなんか、ヘッドホンアンプなんかより遥かに簡単に自作できますが、CPUが数千円でも5万以上で売られることはごく当たり前に行われています。

素人がドライバ一本で行えるパソコンでさえ、これだけの価格差があるのですから、回路の設計からすべて行うなら部品の単価は製品価格の差が大きいのは当然です。

自作した方がいいと思えばそうすればよいだげで、それを売れば儲かると思えば販売すればいいだけです。
実際に零細オーディオメーカーなんかはそうやって誕生したメーカーがいくつもあります。