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圧縮してるからですね。
無圧縮出力が出来ます。
その方法をお試し下さい。

解説サイトさん：
http://www.oshiete-kun.net/archives/2008/03/15_0036.html

http://exsilver.exblog.jp/6327551/

補足：
AVI出力した後に、WMVエンコードしてみては？

それでも画質が気になる場合は、Aviutlという編集ソフトが有ります。
これは至ってシンプルなソフトで、基本はフィルターを掛けるソフトですが、プラグインを導入することによってWMV出力、カット、字幕挿入が出来ます。
使い方を覚えれば簡単です。


Aviutl:
http://spring-fragrance.mints.ne.jp/aviutl/
http://jumper-x.hp.infoseek.co.jp/begin/1aviutl/index.html
http://www.fiberbit.net/user/r2-m2/clare/dtv/aviutl.html


WMV出力プラグイン（Windows Media Output Plugin for Aviutl）：
http://www.ttm123.com/net/AviUtl.html
http://www.katch.ne.jp/~kakonacl/douga/aviutl_tmpgenc/aviutl_tmpgenc.html
http://homepage3.nifty.com/monjya/aviutl.jis.html#wmvout

字幕やカット等、他にも沢山あります。
http://zank.blog8.fc2.com/blog-entry-4671.html

いろいろな解説サイトさん紹介しました。
やりたいことがあったらグーグルで検索し、プラグインを探しましょう。


目的のプラグイン入手法

例１,
「WMVを読み込みたいけど読み込めない」なんて言うときは、「aviutl wmv 入力」と調べましょう。
「入力」とは読み込むと言うことです。
http://www.google.com/search?hl=ja&rls=com.microsoft%3Aja%3AIE-SearchBox&rlz=1I7GGLL_ja&q=aviutl+wmv+%E5%85%A5%E5%8A%9B&lr=&aq=0r&oq=aviutl%E3%80%80wmv%E3%80%80nyuu

例2,
AviutlでWMV動画をカット編集したい場合は「aviutl wmv カット」と調べましょう。
http://www.google.com/search?hl=ja&rls=com.microsoft%3Aja%3AIE-SearchBox&rlz=1I7GGLL_ja&q=aviutl+wmv+%E3%82%AB%E3%83%83%E3%83%88&lr=&aq=f&oq=

でてきたサイトさんを一つずつ見て、目的のプラグイン、やり方を見つけましょう。

長くなりましたすいません。