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想定されている雑誌の大きさはどのくらいですか？

一般家庭向けではA4までの対応のものがほとんどですので
A4サイズやB5サイズの雑誌の見開きや、B4サイズの雑誌のスキャンを行うことができません。

さらに大きなものとなると、事実上A3対応のフラットベッドスキャナぐらいしか選択肢がありません。
この大きさでは軽いものでも20kgぐらいからはありますのでかなり重たいです。
# 後は図面を読み取る業務用の大判スキャナぐらいです。

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ScanSnapは、シートフィーダー方式と呼ばれるタイプのものです。
この方式の場合、設置場所は小さくて済みますが、薄っぺらい用紙しかスキャンすることができません。
そのかわり、連続スキャンや両面同時スキャンをを行うことができる機種もあります。
この方式は基本的にA4までのサイズのものしか市販されていません。

一方、今回のプリンタ複合機のような、コンビニのコピー機のようにガラス面の上に原稿を下向きにセットするものは
フラットベッド方式と呼ばれるタイプのものです。
この方式の場合、設置場所はそれなりに必要ですが、本などを解体せずにそのままスキャンすることも可能です。
基本的には1枚ずつ指示してスキャンさせるしかできませんが
前述のシートフィーダー方式の機能(ADF)を取り付けて片面ずつなら連続スキャンできるものも存在します。

どちらの場合も、スキャンして取り込んだ後にソフトウェアでpdfに変換する必要があります。
またこの際にOCRソフトを併用すると、現行の文字列部分をテキストデータとしてpdfに埋め込むこともできます。
最近はこの手のソフトウェアが標準で付いていることが多いですが、付属していない場合もありますのでご注意ください。

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まずはスキャナの大きさがA4までの対応で問題ないという前提で書きます。
こちらはいずれも安いので、新品を換われることをお勧めします。

雑誌を解体しても問題ない、見開きが別々のページとして切れてしまっても問題がないのであれば
連続してスキャン可能なScanSnapのほうが便利です。
ただし、雑誌の解体には背表紙をきれいに切り落とすための用紙カッターが別途必要になるかもしれません。

雑誌を解体したくない、見開きでページをまたぐ部分もスキャンしたいのであれば
プリンタ複合機や単機能のフラットベッドスキャナを選択するしかありません。
雑誌以外にもいろいろとスキャンしてみたいと思うのであれば、こちらのほうが対応できる場合が多いです。

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次に、A4までの対応では大きさが足りない場合です。
前述の通り、事実上A3対応のフラットベッドスキャナしか選択肢がないです。
この大きさになると、すでに業務用になってしまい、量販店でも売られていない上に新品価格は高いです。
そのかわり、リース上がりのものが中古で出回ることも多いです。

中古は、リース上がりの中古を取り扱う業者や、ヤフオクなどで入手できます。
特に出回る量の多いのは、エプソン Offirioシリーズです。

ただしA3対応の場合、機種によってはUSB接続ができない場合もありますのでご注意ください。
また中古を買われる場合は、実際に原稿面の傷の有無を確認されたうえで買われることをお勧めします。