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外付け光学ドライブがBIOS上で認識されないのは、マザーボードの仕様に起因しておりますので、諦めましょう。
内蔵光学ドライブは、起動順位の変更が出来るなら、認識されてます。

起動順位の最初を内蔵光学ドライブに変えて、恐らく作成していると思われる再セットアップディスクを入れてみれば、BIOSで光学ドライブが認識されている確認になります。
リカバリーをキャンセルし、光学ドライブからリカバリーメディアを抜いて再起動し、再度BIOSに入って起動順位を初期化すれば、万一にもHDD内のファイルが書き直される事も無いので、確認だけ出来ます。

さて（・＿・）、

なぜBIOS上で内蔵・外付け光学ドライブを認識させなければならないかの理由が記載されておりません。
その為、回答も本題とはズレてしまいます。

また、発売後間もなくでも、東芝等の国内資本の一流どころは、数々の修正アップデータを発表しているハズです。
ついでに東芝サイト内を検索して、修正を済ませておきましょう。

http://dynabook.com/assistpc/download/hist/hist_upd_index.htm

【【補足後】】

東芝は機種によって、起動デバイスの指定はF12キーだったり０（ゼロ）キーだったりすると思います。
取扱説明書で、確認してください。

HD革命/CopyDrive CD起動版を光学ドライブに入れ、電源ON時に指定のキーを押してください。
調べるのが難しかったら、F12かゼロキーで試してください。

１、ハードディスク
２、取り外し可能なデバイス（USB/FDD等）
３、CD/DVDドライブ
４、●●●

こんな感じでメニューが出てくるハズです。
何もしなければ、起動の優先順位が高いHDDから起動してしまいます。
お試し下さい（＾－＾）♪