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普通のプロジェクターの寿命とはランプの寿命のことでしょうか。このカメラのランプは高輝度白色LEDですので寿命はかなり長いと思います。

詳細は取説を読んでみてください。
http://www.nikon-image.com/support/manual/coolpix/S1100pj_(10)01.pdf
P.164 プロジェクター使用中はかなり高温になるようです。
P.174 無操作時のオートパワーオフは最長30分のようです。
P.182 カメラが高温になると自動的に電源を切るそうです。
P.194 電池における連続投影時間は最大1時間のようです。

メモリ上の画像を投影するのとPCと接続してPCの画面を投影するのとプロジェクター部分にかける負担が変わるとは思いません。PCに接続して使用したからといって、壊れやすいということはないでしょう。前記のような保護機能も、当たり前のことなんですが、ちゃんと入っているようですし（結果として使い勝手がいいかどうかはわかりませんが）。