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よく交換します。基本的にATミッションは消耗品の塊です
12万ｋｍ超えとのことですが走行環境によっては、あり得る話です
おそらくリビルト品に交換となると思います。
車検・整備は全て購入ディーラーにて行っています。とのことなのでまず点検記録簿を確認し購入時から何回オイル交換（ATF）を実施ししているか確認してください。説明書の交換距離数に対してあまりにも整合性のない点検をしているならクレームを申し出てもいいと思います。
たとえば
説明書が5万ｋｍで交換を推薦しているのに６万km過ぎている点検でも、交換を実施していない場合、実施の勧めがなかった場合。
当然、車検、整備をディーラーに任せている以上、交換推薦時期を超過しているのであれば、ユーザに交換の伺いをするのはディーラーも説明義務があるとおもいます。（あなたが交換断ったなら話は別ですが）
基本
全額負担ということになりますが、すこしその辺を調べておいたほうがいいと思います、

個人的な感覚ですが トヨタのATは長持ちしました、以前乗っていたプロバックスはあまりいい環境ではなかったですが16万ｋｍでリース終了までショックもなくスムーズに走ってくれました。