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1．DDR2 800(MHz) ＝ PC2-6400
2．DDR2 667(MHz) ＝ PC2-5300

Acer Aspire Timeline AS1410ですが仕様では②とされています。
このモデルに限らず、メモリは“同じものを複数枚”が基本です。
周波数だけですと（当たり前ですが）、
1．DDR2 800(MHz) ＞ 2．DDR2 667(MHz)
となりますが、メモリ単体の差＝PC処理速度の差でもない為、1． ＞ 2．は体感さえ出来ない差となります。
（価格差もあまりありません）
ただメモリを2GBから4GBへ増設した差は大きいかと思います。
逆に言いますと①DDR2 800(MHz)を仮に装着されても特段問題はありません。
一応仕様どおりの2．を装着されてはいかがですか。

ご質問ですが、
①装着方法はご質問とおりです。
電源を切るだけでなく、コンセントもバッテリーも外して下さい。
水気は厳禁です。
手でさし込む（フック）だけですので、通電するドライバー（金属類）等も避けて下さい。
②お使いのPCのプログラムや各種設定、データ等には一切（メモリの増設とは）関係ありませんので、増設後即使用出来ます。
PC起動後、
「Ctrl」キー＋「Alt」キー＋「Delete」キーの同時押し。
「タスクマネージャ」起動
「パフォーマンス」タブの「物理メモリ」（MB）で増設された事を確認して下さい。
※メモリが正しく認識されない場合は、以下のトラブルシューティングをご参照下さい。
http://buffalo.jp/qa/ram/make/memori-01_5.html#answer

以上、ご参考まで。

補足
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Acer Aspire Timeline AS1410のスロット（メモリDDR2 667(MHz) ＝ PC2-5300）は200ピンです。
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