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FLVファイルからMP4ファイルへの変換で困っています。
動画は知識が少ないので、ネットで調べてみたのですが、分かりません。 ・OS Win7prox64、WinXPprosp3
・CPU E2180、他
・スマホ Docomo L-07C、他
・テレビ 東芝40A8000
・メディアプレーヤー SONY BDP-S380

DLしたファイルが、YouTubeなどFLV形式が約1,000個ほどあります。
容量は、1ファイルあたり、数十MBから200MBくらいです。
今後ダウンロードする分は直接MP4形式で保存するので、
問題ないのですが、今ある上記FLVファイルが問題なんです。
SONY BDP-S380（本来BDプレーヤー）が、USBメディア再生できるので、
重宝しているのですが、FLVはサポートしていません。（実際ダメでした）
スマホでも再生できるように、また、無劣化変換もできるので、MP4を選びました。

1.Vectorより、「FLVtoMP4」。ffmpegのバージョンが不適当なせいか（？）、
約3割が変換できず、残りの約3割が再生不良で、結果約半分は変換不良。

2.「Any Video Concerter Free」。任意設定で、ある1個170MBのFLVが、
約1.3GBのMP4に。所要時間が1時間以上かかり、現実的に無理。

3.「HugFlash」を見つけたんですが、出力形式が指定できず、2.のファイルは
ほぼ同容量ながら、AVIに。再生してみると、音声が途切れ途切れでした。

ファイル数が少なければ、1個ずつ変換するソフトでも可能ですが、
多いので、一括変換しか現実的に無理で、どうも時間のかかるソフトは
再トランスコード？をするようで、数分で処理が終わるソフトはコンテナを
変更しているだけ、みたいな感じがします。AAC、H264は同じなので、
コンテナだけで良いのですが、フリーで適当なソフトが見つかりません。
また、DLのFLVファイルにも問題があるようで、ネット情報では、ニコ動など、
FLVでも仕様変更があったとかうんぬん。動画に疎いのでよく分かりません。
有料ソフトを使うくらいなら、専用ハードも考えたのですが、
FLV再生に強いらしいプリンストンテクノロジー、の新製品（PAV-MP2YT）が、
今日発売ですが、FLVの注意書きに「VP6には対応しておりません。」と
書いてあり、意味は理解できないのですが、一部か今後増えるある種のFLV
が再生できない様子で、ハードの購入はためらわれます。

Windows環境でなんらかの方法がありましたら、ご教授ください。

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