質問者が納得ウィルスの心配に対して、自身でセキュリティソフトは導入されていないのでしょうか?
業務用なのか、個人使用なのかは分かりませんが、
最低限、信頼できるソセキュリティソフトを導入すべきでしょう。
USBキーの認識については、
ソフトのOSへの対応状況やアップデートなどアプリメーカーの
サポートをまず一番に確認すべきでしょう。
USBキーも使うごとに抜き差しするのか、
常時差したままなのかで認識状態も変わりそうです。
こういうケースは、使っている人達にしか分からない事が多いですから。
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