質問者が納得それは、バックグラウンドで動作してるソフトがほんの一瞬フル画面表示で割り込んでくるためだと思います。
とりあえず、オンラインで無料のウイルスチェックをするかちゃんと最新版に更新されてるセキュリティソフトでウイルスチェックして下さい。
問題なければ、Windowsを再起動し
いつものWindowsのロゴが出る前くらいにF8キーを押してセーフモードで立ち上げてください
セーフモードでも画面が明滅するなら
ctrl+alt+deleteキーを同時押しして
タスクマネージャーを起動し、プロセスに名前が出ている...
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